На авиабазе Нежин (город Нежин, Черниговская область) базировался 199-й гвардейский отдельный дальний разведывательный полк.
На вооружении стояли следующие самолёты:
В 1992 году большинство летчиков и штурманов 199-й гвардейского отдельного дальнего разведывательного полка имело первый класс. Нехватка топлива, запчастей и экономические трудности привели к существенному снижению интенсивности полётов. Несмотря на это, авиаторам удавалось поддерживать высокий уровень подготовки, что подтверждают действия экипажа Ту-22Р 25 мая 1995 года, когда после выполнения задания над нейтральными водами Чёрного моря на их самолёте отказал двигатель[56]. По расчетам штурмана долететь до Нежина неудавалось, и летчик мастерски посадил неисправную машину на запасном аэродроме под Одессой.199‑й ОГДРАП занимался стратегической разведкой на центрально-европейском и юго-западном (ФРГ — Австрия — Греция — Босфор — Мраморное море), и южном (Чёрное море — Турция — Иран) направлениях[56].
Некоторое время Ту-22Р пытались использовать на Украине и в гражданских целях: выполнять фотосъёмку для картографирования, геодезии и землеустройства и проводить мониторинг стихийных бедствий.
В 1995 году на вооружении полка состояло 10 Ту-22Р, 1 Ту-22РДК, 3 Ту-22ПД и 4 Ту-22УД.
30 декабря 1996 года авиаполк был реорганизован в 18-ю отдельную дальнеразведывательную авиационную эскадрилью (одраэ). В боевом составе эскадрильи числились 6 Ан-З0Б, 3 Ту-22Р и 1 Ту-22У.
В начале 1997 года, во время визита кораблей ВМС США на Украину, Ту-22Р совершали патрулирование над Чёрным морем[57].
В июле 1998 года на авиабазе Нежин состоялся последний вылет самолётов типа Ту-22.
22 февраля 1999 года постановлением № 242 Верховной Рады 18-я одраэ передана в состав Министерства по чрезвычайным ситуациям и переименована в 300-й специальный авиационный отряд МЧС.
К 2001 году самолёты типа Ту-22 были утилизированы на базе ликвидации в Нежине.